Анализ транскриптома немодельного объекта (рожь, Secale cereale) для начинающих. Семинар 3.

3 Просмотры

Успейте купить XRumer+XEvil выгодно! При покупке по этой ссылке скидка - 10$ c Лайт, - 20$ с Стандарт, - 30$ с Бизнес лицензии!

Издатель

Понравился видеоролик "Анализ транскриптома немодельного объекта (рожь, Secale cereale) для начинающих. Семинар 3."? Если да, то напиши свой комментарий и поделись им в соцсетях. Тем самым ты поддержишь наш проект. Спасибо!

Описание видео: Темы третьего семинара: 1. 4. Методы их обнаружения. 3. Программы для де-ново сборки. Семинар о подготовке к получению последовательности (сиквенса) транскриптома немодельного объекта (ржи) и его анализа. Графы деБрюина, проблемы при получении возможных транскриптов из графа (линеаризация графа). 5. Пузыри, шпильки, перекрёстки. Очистка сборки от контаминации и коротких последовательностей SeqClean... Возможные ошибки при де-ново сборке. Оценка качества сборки: 5.1 Оценка покрытия поиском количества полноразмерных белок-кодирующих участков для близких видов 5.2 Оценка с использованием программы поиска однокопийных ортологов (BUSCO) 5.3 Оценка количества транскриптов, подтверждающихся исходными прочтениями (TransRate) 6. Использующие графы деБрюина, использующие перекрытие-консенсус (OCL). Выбор и сравнение варианта сборки (де-ново, на референсный транскриптом, на референсный геном, с использованием близкого протеома) 2.

Официальный источник видео youtube.com/watch?v=T9uSMJROlKw именно от туда подгружается разрешенный автором к встраиванию контент и картинки. Авторские права полностью соблюдены!

Категория
Домены Создание сайтов



Яндекс.Метрика